Modul CS4442-KP12

Dauer:

Angebotsturnus:

Studiengang, Fachgebiet und Fachsemester:

• Master Biophysik 2019 (Vertiefung), Vertiefung, 1. und 2. Fachsemester

Qualifikationsziele/Kompetenzen:

• Die Studierenden können indexbasierte Software auf Next-Generation Sequencing Daten anwenden.
• Sie können molekular-biologische Datenbanken nutzen und entwerfen.
• Sie können statistisch signifikante Veränderungen in Microarray-Daten feststellen.
• Studierende haben Kenntnis von elementaren zeitdiskreten Modellen zur Modellierung biologischer Prozesse
• Sie entwickeln die Fähigkeit, Ideen aus verschiedenen mathematischen Disziplinen zusammenzuführen
• Sie haben Kompetenzen in Datenanalyse und Modellierung
• Sie entwickeln Kompetenzen zur interdisziplinären Arbeit
• Die Studierenden sind in der Lage, die Grundkonzepte der Signalverarbeitung in Lebewesen zu erklären
• Sie können Begriffe wie Genom, Transkriptom, Interaktom und Proteom richtig einzuordnen
• Sie können dynamische Systeme und deren Eigenschaften analysieren
• Sie kennen die gängigen Methoden / bioinformatischen Algorithmen
• Praktischen Übungen werden die Studenten ermutigen, ihr Wissen zu diesen Themen zu vertiefen

Vergabe von Leistungspunkten und Benotung durch:

• Mündliche Prüfung

Setzt voraus:

• Stochastik 1 (MA2510-KP04, MA2510)
• Analysis 2 (MA2500-KP04, MA2500)
• Lineare Algebra und Diskrete Strukturen 2 (MA1500-KP08, MA1500)
• Einführung in die Bioinformatik (CS1400-KP04, CS1400)

Modulverantwortlicher:

• Prof. Dr. rer. nat. Thomas Martinetz

Lehrende:

• Lübecker Institut für Experimentelle Dermatologie (LIED)
• Institut für Mathematik
• Institut für Neuro- und Bioinformatik

• Prof. Dr. Bernhard Haubold
• Prof. Dr. rer. nat. Thomas Martinetz
• Dr. rer. nat. Kurt Fellenberg
• Nachfolge von Prof. Dr. rer. nat. Karsten Keller
• Prof. Dr. Hauke Busch
• Dr. Axel Künstner

Literatur:

• M. S. Waterman: Introduction to Computational Biology - London: Chapman and Hall 1995
• B. Haubold, T. Wiehe: Introduction to Computational Biology - Birkhäuser 2007
• R. Durbin, S. Eddy, A. Krogh, G. Mitchison: Biological sequence analysis. Probabilistic models - Cambridge, MA: Cambridge University Press
• J. Setubal, J. Meidanis: Introduction to computational molecular - Pacific Grove: PWS Publishing Company
• D. M. Mount: Bioinformatics - Sequence and Genome - New York: Cold Spring Harbor Press
• F. Braer, C. Castillo-Chavez: Mathematical Models in Population Biology and Epidemiology - New York: Springer 2000
• H. Caswell: Matrix Population Modells - Sunderland: Sinauer Associates 2001
• S. N. Elaydi: An Introduction to Difference Equations - New York: Springer 1999
• B. Huppert: Angewandte Lineare Algebra - Berlin: de Gruyter 1990
• U. Krengel: Einführung in die Wahrscheinlichkeitstheorie und Statistik - Wiesbaden: Vieweg 2002
• E. Seneta: Non-negative Matrices and Markov Chains - New York: Springer 1981
• Marian Walhout, Marc Vidal, Job Dekker: Handbook of Systems Biology: Concepts and Insights - (Englisch) Gebundene Ausgabe – 15. November 2012
• Edda Klipp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling, Axel Kowald;: Systems Biology: A Textbook - (Englisch) Taschenbuch – 20. April 2016
• Yoram Vodovotz and Gary: An Translational Systems Biology, Concepts and Practice for the Future of Biomedical Research

Sprache:

• Sowohl Deutsch- wie Englischkenntnisse nötig

Bemerkungen:

(Besteht aus CS4440 T, MA4450 T-INF, EW4170 T)
(Ist gleich CS4516-KP12)

Zulassungsvoraussetzungen zum Modul:
- Keine (Die Kompetenzen der vorausgesetzten Module werden für dieses Modul benötigt, die Module stellen aber keine Zulassungsvoraussetzung dar.)

Zulassungsvoraussetzungen zur Prüfung:
- abhängig von den Teilmodulen

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