Modul LS5200 SC

Modulteil: Structure-based design and synthesis of an antiviral compound (DDSyn)

1 Semester

Jedes Wintersemester

Master Molecular Life Science 2009 (Modulteil eines Pflichtmoduls), Vertiefung in MLS, 3. Fachsemester

Versuch 1: Rekombinante Herstellung der 3C-Protease (3Cpro) des Coxsackievirus B3 in E. coli, Reinigung des Proteins, Aktivitätstest
Versuch 2: Kristallisation der 3Cpro. Es werden Bedingungen gewählt, die in wenigen Stunden zu Kristallen führen
Versuch 3: Diffraktionsdatensammlung an diesen Kristallen oder, bei nicht hinreichender Qualität, an zuvor vorbereiteten Kristallen
Versuch 4: Interpretation der Elektronendichte und Modellierung eines Inhibitors
Versuch 5: Praktische Durchführung von zwei Stufen aus der Synthese eines Inhibitors, Bestimmung der Identität des Produkts mittels ESI-Massenspektrometrie und evtl NMR-Spektroskopie
Versuch 6: Bestimmung kinetischer Parameter mit FRET: IC50 und kkat/KM
Versuch 7: Arbeiten mit Replikons, Transfektion, Bestimmung von EC50

Dieser praktische Übungskurs gibt einen interdisziplinären Einblick in das Design und die chemische Synthese von antiviralen Hemmstoffen. Alle Arbeiten werden von den Studierenden selbst durchgeführt. Der Kurs baut auf auf dem Wissen, welches die Studierenden in den Lehrveranstaltungen Virologie, Biochemie, Strukturanalyse/Kristallographie, Rational Drug Design, Organische Chemie und Biologische Chemie erworben haben.