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Modulhandbuch ab WS 2019/20

Modul EW4170 T

Modulteil: Systembiologie (SystBioT)

Dauer:


1 Semester
Angebotsturnus:


Jedes Wintersemester
Leistungspunkte:


4
Studiengang, Fachgebiet und Fachsemester:
  • Master Entrepreneurship in digitalen Technologien 2020 (Modulteil eines Wahlmoduls), Modulteil, Beliebiges Fachsemester
  • Master Informatik 2019 (Modulteil eines Wahlmoduls), Modulteil, Beliebiges Fachsemester
Lehrveranstaltungen:
  • EW4170-Ü: Einführung in die klassische und translationale Systembiologie (Übung, 2 SWS)
  • EW4170-V: Einführung in die klassische und translationale Systembiologie (Vorlesung, 2 SWS)
Workload:
  • 60 Stunden Präsenzstudium
  • 50 Stunden Selbststudium
  • 10 Stunden Prüfungsvorbereitung
Lehrinhalte:
  • Einführung in das Genom und Proteom von zellulären Systemen
  • Netzwerke: zelluläre, genetische, genregulatorische Netzwerke, Interaktom, Transkriptom und Proteom
  • Analyse von dynamischen Systemen: Fixpunkte, Bifurkationen, Feedback
  • Anwendungsbeispiele translationaler Systembiologie
  • Bioinformatische Analysen von Omics Daten
  • Einführung in öffentliche Datenbanken: z.B. STRING, Gene Expression Omnibus, TCGA, KEGG, Reactome, MSigDB
  • Übungen: Praktische Übungen zu Analyse von dynamischen Systemen und zellulären Signalwegen in R
  • Übungen zum Einlesen, Analysieren und Visualisieren von hochdimensionalen Daten mit R
  • Übungen zur Analyse von Proteininteraktionsnetzwerken
Qualifikationsziele/Kompetenzen:
  • Die Studierenden sind in der Lage, die Grundkonzepte der Signalverarbeitung in Lebewesen zu erklären
  • Sie können Begriffe wie Genom, Transkriptom, Interaktom und Proteom richtig einzuordnen
  • Sie können dynamische Systeme und deren Eigenschaften analysieren
  • Sie kennen die gängigen Methoden / bioinformatischen Algorithmen
  • Praktischen Übungen werden die Studenten ermutigen, ihr Wissen zu diesen Themen zu vertiefen
Vergabe von Leistungspunkten und Benotung durch:
  • Übungsaufgaben
  • Klausur
Modulverantwortlicher:
Lehrende:
Literatur:
  • Marian Walhout, Marc Vidal, Job Dekker: Handbook of Systems Biology: Concepts and Insights - (Englisch) Gebundene Ausgabe – 15. November 2012
  • Edda Klipp, Wolfram Liebermeister, Christoph Wierling, Axel Kowald;: Systems Biology: A Textbook - Englisch) Taschenbuch – 20. April 2016
  • Yoram Vodovotz and Gary: An Translational Systems Biology, Concepts and Practice for the Future of Biomedical Research
Sprache:
  • Wird nur auf Englisch angeboten
Bemerkungen:

(Ist Teilmodul von CS4516-KP12, CS5400)

Veranstaltungen auch genutzt in CS4442-KP12.

Letzte Änderung:
29.10.2019

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